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1、对于这问题，你公司和税务机关的作法都有欠妥之处： 首先，你们公司作为一个企业，有义务完善公司的财务制度，但在年初的时候，你们公司选择纳税方式没有正确的选择，这个在每年年初的时候，税务机关都会发给你们一张纳税认定表，上面有你们公司的纳税方式，虽然没有看到那个原件，我想你们肯定选择了核定征收的方式。
2、根据国家税务总局的核定征收的相关办法，一般确定为核定征收后，一年内不能改变，也不能对税额进行调整。
3、 其次，税务机关的做法也有欠妥，查帐征收，不是说收入多少才可以作为查帐征收企业，只要纳税人帐证健全、核算清楚，就可以申请成为查帐征收的纳税人。
4、 第三，在纳税人确定为核定征收的方式下，如果纳税人建立健全自己的帐证，能核算清楚，也可以申请成为查帐征收的纳税人，但只能在纳税人申请并批准后的月份才能作为查帐征收的月份，以前的不能作为查帐征收的月份。
5、 第四，你公司申请查帐征收，是否做到“财务健全,能准确核算收入、支出、成本费用以及税金”这些条件？如果没做到，也不可以申请的，不是说收入达到多少就可以申请的。
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